1、小儿癫痫病的病因之遗传代谢病。如果患者过度依赖苯丙酮尿症、高氨血症、脑脂质沉积症、维生素B6等，就很有可能会得癫痫。另外，还有一种特殊的围产期脑损伤所造成的小儿癫痫。比如主要是产伤、窒息、颅内出血、缺氧、缺血性脑病等所造成的。
3、像细菌性脑膜炎、脑脓肿、病毒性脑炎、霉菌性脑膜炎、脑寄生虫病、接种后脑炎、传染后脑炎等所造成的颅内感染也会间接的引起小儿癫痫的发生。此外，脑血管疾病也可能会是小儿癫痫病的病因。
4、小儿癫痫病这类患者往往有先天脑发育畸形的情况。如果没有先天性脑发育畸形的话，那么就是灰质异位症。此外患者可能还会有神经皮肤综合症。神经皮肤综合症中最常见的就是结节性硬化，神经纤维瘤病和脑三叉血管瘤病等。