衔接课程也称对应课程，即衔接考试计划中对应专科阶段的课程，其学分和学时数达到了衔接考试计划要求的，由主考学校出题，通过市考办审查后，再由主考学校组织考试。其成绩认定标准是专科段课程占40%，本科段课程占60%。
如专科段没有学习或无成绩的对应课程，考生必须参加该课程的统一考试；如学分或学时数达不到衔接考试计划要求，则由主考学校安排相应课程的教学，补足学分或学时数，再组织考试。主考院校和园区派优秀教师指导平时教学，考前组织学生统一辅导勾画重点范围、发放相应的复习资料。考试时间每年5月、11月。
衔接课程主要出现在本科段自学考试中，比如你考经济管理系的行政管理本科段，如果你专科是学工业自动化(非经管专业)，那你就需要考2~3门的衔接课程，简单的说就是学习本科段中某些课程的专科基础知识。