复旦大学医学院是一本大学。复旦大学医学院现官方名为：复旦大学上海医学院。上海医学院一号医学科研楼（复星楼）、学生书院、医科图书馆、综合游泳馆、地下停车库的楼宇已投入使用，二号医学科研楼正在建设中。
复旦大学上海医学院有直属院系所9个。设有本科专业9个：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、临床医学（六年制）、基础医学、法医学、预防医学、公共事业管理、药学、护理学，高职专业1个：护理。
复旦大学上海医学院有博士学位授予权的一级学科9个（医学门类6个，非医学门类3个），设有博士后科研流动站8个：生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、公共管理（医）、护理学。在校博士研究生2731人，硕士研究生2899人，普通本科生4035人，专科生113人，共计9665人。