张仲景的著作有《伤寒杂病论》、《伤寒论》、《金匮要略方论》、《辨伤寒》十卷、《评病药方》一卷，《疗妇人方》二卷，《五藏论》一卷，《口齿论》一卷等。
在这些著作中，《伤寒杂病论》(已经失传，中医四大经典著作之一)书中全面阐述了中医的理论和治病原则，是我国最早的理论联系实际的临床诊疗专书。《伤寒论》，晋代太医王叔和根据自己搜寻到《伤寒杂病论》的伤寒部分的轶文整理而成。《金匮要略》，宋代王洙、林亿、孙奇等人在偶然的机会发现《伤寒杂病论》残简，将关于杂病的部分整理成册，更名为《金匮要略》刊行于世。
其中，《伤寒杂病论》是一部传世巨作。是中国第一部从理论到实践、确立辨证论治法则的医学专著，是中国医学史上影响最大的著作之一，是后学者研习中医必备的经典著作，广泛受到医学生和临床大夫的重视。