芥末打开后，常温下保质期三天。而米粉的芥末酱或者芥末膏在常温下密封存储，避光防潮，保质期在6个月左右。通常使用的是芥末粉或芥末酱，以色正味冲、无杂质者为佳品，芥末不宜长期存放，当有油脂渗出并变苦时，就不要继续食用了。
芥末一般分绿芥末和黄芥末两种，其中黄芥末是芥菜的种子研磨而成，而绿芥末是用辣根制作而成。芥末在日常食用中的作用主要是刺激唾液和胃液的分泌，能增强食欲，其中增强食欲的主要成分是芥子油，其辣味强烈，可刺激唾液和胃液的分泌。
芥末微苦，辛辣芳香，对口舌有强烈刺激，味道十分独特，芥末粉润湿后有香气喷出，具有催泪性的强烈刺激性辣味，对味觉、嗅觉均有刺激作用。可用作泡菜、腌渍生肉或拌沙拉时的调味品。
此外，芥末还具有除臭效果和预防因生活习惯而产生的疾病的效果。芥末溶于适量的水还可以起到抑制、清除霉菌的作用。